1934年，刚成立的国立西北农林高等专科学校在农科专业中开设了农产制造课程，是我国较早开始食品科学与工程教育的记载之一。1936年，园艺组开设农产制造学课程，畜牧兽医组开设畜产制造学课程，森林组开设林产制造课程。1946年，创设农产制造系，是我国近代最早进行食品科学与工程系统教育的高等教育机构之一。中华人民共和国成立后，学科建设在农学、园艺、畜牧、林学、农化等相关专业得到长足发展。
1985年，成立食品科学系，当年开始招收本科生。1999年，成立食品科学与工程学院。学院现设有食品科技系、食品安全系、食品营养系，开设食品科学与工程、食品质量与安全、食品营养与健康3个本科专业和1个中外合作办学本科专业（中美“3+1”食品科学与工程专业）。其中，食品科学与工程专业和食品质量与安全专业获批国家一流专业建设，食品科学与工程专业通过工程教育认证，食品质量与安全专业和食品营养与健康专业分别于2001年和2019年在全国率先创办。
1986年获批农产品加工及贮藏工程二级学科硕士学位授权点，2000年获批食品科学二级学科博士学位授权点，2006年获批食品科学与工程一级学科博士学位授权点，2007年获批博士后流动站，2021年获批生物与医药类别博士专业学位授权点。学院现有食品科学与工程一级学科博士学位授权点和博士后流动站，有食品科学、粮食油脂及植物蛋白工程、农产品加工及贮藏工程、水产品加工及贮藏工程4个二级学科的博士和硕士学位授权点，生物与医药类别的博士和硕士专业学位授权点，食品加工与安全领域硕士专业学位授权点。
学院拥有国家杨凌农业综合试验工程技术研究中心1个国家级平台；拥有农业农村部农产品质量安全风险评估实验室（杨凌）、农业农村部西北果品质量安全监督检验中心、陕西省农产品加工工程技术研究中心、陕西省乳制品质量安全与健康工程技术研究中心、粮油功能化加工陕西省高校工程研究中心、预制菜陕西省高校工程研究中心6个省部级科研基地；拥有陕西省“四主体一联合”谷物加工技术、功能性油脂技术2个校企联合研究中心；拥有农业农村部食品质量监督检验测试中心（杨凌）、农业农村部植物新品种保护测试（杨凌）分中心2个省部级检测机构；拥有全国农产品地理标志产品品质鉴定检测资质、全国名特优新农产品营养品质评价鉴定机构2个定点检测资质。
学院现有教职工140人，专任教师98人，其中教授33人，副教授59人；博士生导师47人，硕士生导师86人；国务院学位委员会学科评议组成员1名，享受国务院特殊津贴专家2名，国家级人才项目入选者3名，教育部“新世纪优秀人才计划”入选者2名，人社部高层次人才回国资助项目1名，陕西省杰出青年基金获得者1名，陕西省高层次人才“特支计划”区域发展人才入选者3名，陕西省青年科技新星入选者6名，陕西省高校科协青年人才托举计划入选者5名。
学院现有全日制在校本科生1440人，各类研究生888人。建院35年来，共培养本科生、硕士生、博士生（含博士后）、留学生8000余人，为食品行业和高校科研院所等培养了一大批高素质专门人才。
近五年来，学院共承担课题430项，总经费1.1亿元，其中，国家重点研发计划、国家科技攻关项目、国家科技支撑计划、国家自然科学基金、农业农村部公益性行业专项等60余项；陕西省攻关、基金、地方委托及横向合作项目300余项。先后获得陕西省科技进步奖一等奖3项、二等奖3项、三等奖2项、各级科技进步奖18项，技术转让50多项。在Nature Communication, Cell Metabolism和Science Advances等国际顶级期刊上发表论文900余篇。
学院与美国加州大学戴维斯分校、康奈尔大学、马里兰大学、加拿大圭尔夫大学、荷兰格罗宁根大学等40多所国际知名大学及科研机构建立了良好的合作关系。2014年，与美国加州大学戴维斯分校合作，牵头组建中美食品安全联合研究中心；2015年经教育部批准，与美国内布拉斯加林肯大学合作创办食品科学与工程本科专业。
秉承“行思至善，食安天下”的学院文化，贯彻“12345”发展思路，实施“34531”发展路径，以育人为根本，教学为基础，加强科学研究，立足陕西，面向全国，开拓海外，突出产学研紧密结合，聚焦旱区食品重大科学和技术问题，努力建成集高层次创新型人才培养、高水平科学研究和高新技术示范于一体的特色鲜明、和谐文明、国际知名、国内一流的食品学院。
