张磊
一、个人简介
张磊，男，汉族，教授，博士生导师。先后主持国家自然科学基金、国家重点研发计划子课题、陕西省自然科学基础研究计划项目等国家及省部级课题；入选 “高层次人才发展支持计划”青年拔尖人才A2岗；国家自然科学基金委员会生命科学部通讯评议专家、教育部学位论文通讯评议专家，以第一或通讯作者在Nature Communications、Microbiome、Applied and Environmental Microbiology等刊物上发表SCI论文30余篇。
二、教育及研究经历
2004年本科毕业于武汉大学生命科学学院生物科学专业；2004-2009年在武汉大学生命科学学院硕博连读，获生物化学与分子生物学专业博士学位；2009年进入 生命科学学院微生物专业从事教学和科研工作。2015年3月至2016年3月在美国内布拉斯加大学-林肯分校以访问学者进行合作研究。
三、研究方向
以植物根际及内生菌、肠道病原菌为主要研究对象，通过分子生物学，生物化学，生物信息学等手段，研究微生物与宿主、环境三者之间的相互关系，主要包括：
1) 微生物的环境响应及适应机制；
2) 细菌-宿主跨界互作的分子机制；
3) 内生菌促作物抗旱抗逆机制。
四、教学工作
承担《微生物学》《微生物实验》《发酵工程生产实习》等本科课程；承担《微生物遗传学》《微生物学研究进展》等研究生课程。
五、科研项目
主持国家自然科学基金面上项目：LuxS/AI-2群体感应系统通过c-di-GMP信号通路调控鼠伤寒沙门氏菌致病性的分子机制研究(32170048)，2022.01-2025.12；
主持国家重点研发计划子课题“难降解有毒污染物智能降解体系的设计与装配(2018YFA0901203)”，2019.07-2024.06；
主持国家自然科学基金面上项目：西北荒漠耐旱植物骆驼刺内生菌 Pantoea alhagi LTYR-11Z提高小麦抗旱性的机理研究(31770121)，2018.01-2021.12；
主持国家自然科学青年基金：秦岭“太白七药”内生菌多样性及其功能菌株筛选(31100001)，2012.01-2014.12；
主持陕西省自然科学基金：靶向细菌FabI酶的药用植物内生放线菌筛选及活性代谢产物研究(2016JM3014)，2016.01-2017.12；
主持陕西省自然科学基金：秦岭太白红杉林土壤宏基因组文库构建及生物活性筛选(2012JQ3006)，2012.01-2013.12；
主持中国博士后科学基金：黄土高原旱地春玉米高产栽培体系土壤微生物响应及评价(20100481373)，2010.12-2012.12；
主持博士科研启动基金：高寒草地植被退化过程中根际微生物的响应，2009.10-2012.12。
主持中央高校基本科研业务费项目：骆驼刺泛菌T3SS效应蛋白RopAA调控作物抗旱性的机制研究，2019.01-2019.12。
六、近年来代表性论文(*为通讯作者)：
1) Li S#, Sun H#, Li J, Zhao Y, Wang R, Xu L, Duan C, Li J, Wang Z, Liu Q, Wang Y, Ouyang S*, Shen X*, Zhang L*. Autoinducer-2 and bile salts induce c-di-GMP synthesis to repress the T3SS via a T3SS chaperone. Nature Communications 2022, 13, 6684.
2) Liu X#, Liu Q#, Sun S, Sun H, Wang Y, Shen X*, Zhang L*. Exploring AI-2-mediated interspecies communications within rumen microbial communities. Microbiome . 2022, 10, 167.
3) Zhang L#*, Li S#, Liu X, Wang Z, Jiang M, Wang R, Xie L, Liu Q, Xie X, Shang D, Li M, Wei Z, Wang Y, Fan C, Luo ZQ*, Shen X*. Sensing of autoinducer-2 by functionally distinct receptors in prokaryotes. Nature Communications 2020, 11, 5371. (入选Nature Communications Editors' Highlight)
4) Wang Z, Xie X, Shang D, Xie L, Hua Y, Song L, Yang Y, Wang Y, Shen X*, Zhang L*. A c-di-GMP Signaling Cascade Controls Motility, Biofilm Formation, and Virulence in Burkholderia thailandensis . Applied and Environmental Microbiology , 2022, 88, e0252921.
5) Zhang L#, Zhang W#, Li Q, Cui R, Wang Z, Wang Y, Zhang YZ, Ding W*, Shen X*. Chen C, Qu M, Li M, Wang Y, Shen X*.Deciphering the root endosphere microbiome of the desert plant Alhagi sparsifolia for drought resistance-promoting bacteria, Applied and Environmental Microbiology , 2020, 86, e02863-19.
6) Shuyu Li, Hong Liang, Zhiyan Wei, Haonan Bai, Mengyun Li, Qiqi Li, Meng Qu, Xihui Shen, Yao Wang*, Lei Zhang*. An Osmoregulatory Mechanism Operating through OmpR and LrhA Controls the Motile-Sessile Switch in the Plant Growth-Promoting Bacterium Pantoea alhagi. Applied and Environmental Microbiology . 2019, AEM.00077-19.
7) Lei Zhang#*, Muhang Li#, Qiqi Li, Chaoqiong Chen, Meng Qu, Mengyun Li, Yao Wang, Xihui Shen*. The Catabolite Repressor/Activator Cra Is a Bridge Connecting Carbon Metabolism and Host Colonization in the Plant Drought Resistance-Promoting Bacterium Pantoea alhagi LTYR-11Z. Applied and Environmental Microbiology . 2018, pii: e00054-18. (Spotlight article)
8) Zhang L#, Zhong J#, Liu H, Xin K, Chen C, Li Q, Wei Y, Wang Y, Chen F*, Shen X*. Complete genome sequence of the drought resistance-promoting endophyte Klebsiella sp. LTGPAF-6F. J Biotechnol . 2017, 246:36-39.
9) Chen C#, Xin K#, Liu H, Cheng J, Shen X, Wang Y, Zhang L*. Pantoea alhagi , a novel endophytic bacterium with ability to improve growth and drought tolerance in wheat. Sci. Rep. 2017, 7:41564.
10) Si M#, Zhang L#, Chaudhry MT#, Ding W, Xu Y, Chen C, Akbar A, Shen X*, Liu SJ. Corynebacterium glutamicum methionine sulfoxide reductase A uses both mycoredoxin and thioredoxin for regeneration and oxidative stress resistance. Applied and Environmental Microbiology . 2015, pii: AEM.04221-14.
11) Si MR#, Zhang L#, Yang ZF, Xu YX, Liu YB, Jiang CY, Wang Y, Shen XH*, Liu SJ. NrdH Redoxin Enhances Resistance to Multiple Oxidative Stresses by Acting as a Peroxidase Cofactor in Corynebacterium glutamicum . Applied and Environmental Microbiology . 2014, 80(5):1750-1762.
12) Zhu L#, Si M#, Li C, Xin K, Chen C, Shi X, Huang R, Zhao L, Shen X, Zhang L*. Sphingomonas gei sp. nov., isolated from roots of Geum aleppicum . Int J Syst Evol Microbiol. 2015, 65: 1160-1166.
13) Wei L#, Si M#, Long M, Zhu L, Li C, Shen X, Wang Y, Zhao L, Zhang L*. Rhizobacter bergeniae sp. nov., isolated from the root of Bergenia scopulosa . Int J Syst Evol Microbiol. 2015, 65:479-484.
14) Zhu L#, Long M#, Si M, Wei L, Li C, Zhao L, Shen X, Wang Y, Zhang L*. Asticcacaulis endophyticus sp. nov., a prosthecate bacterium isolated from the root of Geum aleppicum . Int J Syst Evol Microbiol . 2014, 64:3964-3969.
15) Zhang L, Wang Y, Wei L, Wang Y, Shen X*, Li S. Taibaiella smilacinae gen. nov., sp. nov., an endophytic member of the family Chitinophagaceae isolated from the stem of Smilacina japonica , and emended description of Flavihumibacter petaseus . Int J Syst Evol Microbiol , 2013, 63:3769-3776.
16) Zhang L, Shen X, Liu Y, Li S*. Nafulsella turpanensis gen. nov., sp. nov., a novel member of the phylum Bacteroidetes isolated from soil of an arid area in Xinjiang, China. Int J Syst Evol Microbiol , 2013, 63:1639-1645.
七、联系方式及招生信息
招收硕士生、博士生，具备扎实的分子生物学知识及实验技能者优先；也欢迎博士后加入。有意者请EMAIL联系。
地址： 生命科学学院，陕西杨凌，712100
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