是教育部直属的一所综合性全国重点大学， 1999年9月11日，由共处陕西杨凌的原西北农业大学、 西北林学院、 中国科学院水利部水土保持研究所、水利部西北水利科学研究所、陕西省农业科学院、陕西省林业科学院、陕西省中国科学院西北植物研究所等7个教学、科研单位合并组建的。学校为副部级建制，实行部省共建联合办学的新体制，重大事项以教育部为主，日常管理以陕西省为主。2004年6月进入国家"985工程"建设序列。学校历史可追溯到1934年于右任先生创办的国立西北农林专科学校。

        西北农业大学前身是国立西北农林专科学校，创建于1934年。1938年与国立西北联合大学农学院、河南大学农学院畜牧系合并，成立国立西北农学院；解放后更名为西北农学院。 1985年经原农牧渔业部批准，更名为西北农业大学。1999年9月并入 。

        西北林学院其前身是原西北农学院森林系，成立于1934年。1979年从西北农学院分出，成立西北林学院。由林业部与陕西省双重领导，以林业部为主。1999年9月并入 。

        中国科学院.水利部水土保持研究所 中国科学院1954年决定筹建西北农业生物研究所，所址选定为陕西武功。1955年定名为中国科学院西北农业生物研究所，先后更名为中国科学院 西北生物土壤研究所、中国科学院西北水土保持生物土壤研究所、 "中国科学院西北水土保持研究所、 中国科学院、水利部西北水土保持研究所。1995更名为中国科学院水利部水土保持研究所。1998年被中国科学院确定为首批启动的国家知识创新工程试点单位之一。1999年9月并入 。

        水利部西北水利科学研究所  1940年西北农学院与中央水工实验所（后称中央水利实验处）合办武功水工实验室， 1952年扩建为西北水工实验所。之后，先后更名为西北水利科学研究所、陕西省水利科学研究所、水利部西北水利科学研究所、陕西省水利科学研究所、水利部西北水利科学研究所。1999年9月并入 。

        陕西省农业科学院 前身是西北农业科学研究所，于1952年由西北军政委员会农林部筹建成立。1954年隶属农业部，1958年改由中国农科院、陕西省农林厅双重领导，更名为中国农业科学院陕西分院。1973年划归陕西省农牧厅领导，更名为陕西省农林科学院，1983年定名为陕西省农业科学院。1999年9月并入 。

        陕西省林业研究所 前身系陕西省林业研究所，成立于1958年，属中国农业科学院陕西分院的一个专业研究所。1980年从陕西省农林科学院分出，成立陕西省林业科学研究所，归省林业厅领导。1998年更名为陕西省林业科学院。1999年9月并入 。

        陕西省中国科学院西北植物研究所  前身系中国科学院1965年组建的综合性植物学专业研究机构-中国科学院西北植物研究所。1970年7月下放陕西省管理。1982更名为西北植物研究所。1991年实行陕西省与中国科学院双重领导体制，更名为"陕西省.中国科学院西北植物研究所"。1999年9月并入 。